Ich dachte, dass die Übersäuerung des Muskels durch Milchsäure (Laktate, Salz der Milchsäure) die Urache des Muskelkaters sind, doch nun lese ich auf Wikipedia zu Muskelkater:

Diese Hypothese ist jedoch durch folgende Fakten widerlegt worden:
* Nach der Laktathypothese müsste ein Muskelkater besonders durch sportliche Betätigungen entstehen, bei denen sehr hohe Laktatwerte gemessen werden, wie zum Beispiel beim 400-Meter-Lauf. Die Praxis zeigt jedoch, dass er häufiger nach Krafttraining auftritt, bei dem nicht so viel Laktat gebildet wird.
* Laktat hat eine Halbwertszeit von etwa 20 Minuten. Ein Muskelkater tritt aber erst Stunden später auf, nachdem sich der Laktatspiegel längst normalisiert hat.

Heute nimmt man an, dass – wie Beobachtungen zeigen – durch Überlastung kleine Risse in den Z-Scheiben im Muskelgewebe (Mikrotraumata) auftreten. Dies sind gewissermaßen die äußeren Abgrenzungen kleiner Abschnitte innerhalb der Muskelfibrille.

Weitere interessante Artikel dazu:
Muskelkater – aerzteblatt.de
Muskelkater auf sportuntericht.de

Die gute Nachricht laut aerzteblatt.de:

Bei beiden Muskelkaterformen sind keine wesentlichen Dauerschäden zu beobachten. Es kommt zu vollständiger Regeneration; selbst gelegentliche Faseratrophien sind reversibel.